Factores Transcripcionales
La producción de hnRNA por RNA pol II requiere una regulación más compleja que involucra un mayor número y tipos de factores de transcripción. Como se mencionó anteriormente, los factores de transcripción son proteínas que se unen al ADN en promotores, potenciadores o silenciadores para controlar la expresión génica. Se unen al ADN reconociendo secuencias específicas, aunque una misma secuencia puede ser reconocida por múltiples TF, que pueden ser activadores o represores. Los factores de transcripción se clasifican según sus funciones en factores de transcripción generales o basales y factores de transcripción inducibles.
Factores de transcripción (TF) generales o basales
Se requieren en todos los promotores centrales para iniciar la transcripción. Se unen a RNA pol para formar un complejo alrededor del sitio de iniciación que determina la iniciación. Los factores de transcripción reciben el nombre del polo de ARN sobre el que actúan y juntos forman la maquinaria básica de transcripción. Así, un TF que interacciona con la RNA pol I se denomina TF I; los que interactúan con RNA pol II, TF II, y los que interactúan con RNA pol III, TF III.
Factor de transcripción inducible
El conjunto de TF necesarios para la expresión génica específica es específico de cada promotor. Los TF inducibles o TF específicos de tejido interactúan con el ADN de la misma manera que los TF generales, pero su actividad es más reguladora y se une principalmente a los promotores distales. Se sintetizan o activan en respuesta a estímulos y controlan la transcripción temporal y espacial. Los genes con promotores contienen secuencias reconocidas solo por TF generales, se pueden transcribir en cualquier tipo de célula y son responsables de la expresión de genes expresados constitutivamente en estas células. Por el contrario, los genes controlados por TF inducibles requieren la formación de complejos mediadores estimulados estocásticamente.